De club werd opgericht in 1933 en sloot zich tijdens de Tweede Wereldoorlog aan bij de Belgische Voetbalbond. FC Zemst bleef in de provinciale reeksen spelen.
In 2007-08 werd FC Zemst Sportief met groot verschil kampioen in de 4e provinciale reeks G van Brabant. Sindsdien speelt het team onafgebroken op het derde provinciale niveau. Na jarenlang in de middenmoot te spelen, eindigen ze sinds 2017-18 vrijwel altijd bovenaan in de reeks. In 2022 grepen ze na eindrondes net naast de promotie.